Sumber dana awal PT INTI MULTIMA SERTIFIKASI berasal dari setoran pemegang saham.  Selanjutnya PT INTI MULTIMA SERTIFIKASI melakukan kegiatan operasional untuk proses sertifikasi berdasarkan dana yang berasal dari klien sertifikasi. Biaya sertifikasi yang ditagihkan kepada klien sesuai kesepakatan klien dengan  PT INTI MULITMA SERTIFIKASI. Pengelolaan keuangan untuk kegiatan sertifikasi  merupakan tanggungjawab Manager Administrasi Umum dan Keuangan.

Besarnya biaya sertifikasi ditentukan oleh jenis ruang lingkup skema sertifikasi yang diajukan oleh klien. Masing-masing ruang lingkup telah memiliki acuan besaran dan perhitungan biaya sertifikasi berdasarkan peraturan dari kementerian terkait pemilik skema sertifikasi.

PT. INTI MULTIMA SERTIFIKASI mampu menunjukkan bahwa telah dilakukan evaluasi resiko yang timbul dari kegiatan sertifikasinya dengan menyediakan dana cadangan dalam operasional lembaga sertifikasi dan memiliki pengaturan yang cukup untuk menanggung pertanggunggugatan yang timbul dari kegiatan sertifikasi yang dilakukan. Dana cadangan tersebut diwujudkan dalam bentuk barang yang likuid dan dana tunai dengan jumlah tertentu setiap bulan.

Evaluasi resiko yang diperhitungkan oleh PT INTI MULTIMA SERTIFIKASI telah mempertimbangkan potensi resiko kegiatan sertifikasi dan jumlah klien.